Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERINC4A6NH21 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC4A6NH21 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms