Protein–RNA interactions for Protein: A4QPB2

LRP5L, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5LA4QPB2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRP5LA4QPB2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRP5LA4QPB2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms