Protein–RNA interactions for Protein: A0A0C4DH30

IGHV3-16, Immunoglobulin heavy variable 3-16 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-16A0A0C4DH30 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IGHV3-16A0A0C4DH30 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IGHV3-16A0A0C4DH30 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IGHV3-16A0A0C4DH30 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IGHV3-16A0A0C4DH30 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IGHV3-16A0A0C4DH30 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IGHV3-16A0A0C4DH30 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IGHV3-16A0A0C4DH30 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IGHV3-16A0A0C4DH30 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IGHV3-16A0A0C4DH30 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IGHV3-16A0A0C4DH30 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IGHV3-16A0A0C4DH30 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IGHV3-16A0A0C4DH30 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IGHV3-16A0A0C4DH30 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IGHV3-16A0A0C4DH30 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IGHV3-16A0A0C4DH30 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IGHV3-16A0A0C4DH30 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IGHV3-16A0A0C4DH30 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IGHV3-16A0A0C4DH30 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IGHV3-16A0A0C4DH30 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IGHV3-16A0A0C4DH30 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IGHV3-16A0A0C4DH30 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IGHV3-16A0A0C4DH30 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IGHV3-16A0A0C4DH30 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IGHV3-16A0A0C4DH30 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IGHV3-16A0A0C4DH30 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IGHV3-16A0A0C4DH30 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IGHV3-16A0A0C4DH30 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IGHV3-16A0A0C4DH30 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IGHV3-16A0A0C4DH30 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
IGHV3-16A0A0C4DH30 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IGHV3-16A0A0C4DH30 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IGHV3-16A0A0C4DH30 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IGHV3-16A0A0C4DH30 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IGHV3-16A0A0C4DH30 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IGHV3-16A0A0C4DH30 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
IGHV3-16A0A0C4DH30 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IGHV3-16A0A0C4DH30 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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IGHV3-16A0A0C4DH30 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IGHV3-16A0A0C4DH30 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IGHV3-16A0A0C4DH30 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IGHV3-16A0A0C4DH30 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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IGHV3-16A0A0C4DH30 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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IGHV3-16A0A0C4DH30 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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IGHV3-16A0A0C4DH30 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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IGHV3-16A0A0C4DH30 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IGHV3-16A0A0C4DH30 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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