Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG4BQ9Y4P1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms