Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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SH3BP1Q9Y3L3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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SH3BP1Q9Y3L3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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SH3BP1Q9Y3L3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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SH3BP1Q9Y3L3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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SH3BP1Q9Y3L3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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SH3BP1Q9Y3L3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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SH3BP1Q9Y3L3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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SH3BP1Q9Y3L3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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