Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TRAPPC8Q9Y2L5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms