Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms