Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms