Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGSF9BQ9UPX0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGSF9BQ9UPX0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms