Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF346Q9UL40 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms