Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MRTO4Q9UKD2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms