Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNL1Q9UK58 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms