Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms