Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATPIF1Q9UII2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms