Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HMGXB4Q9UGU5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGXB4Q9UGU5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms