Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFDP1Q9UEE9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFDP1Q9UEE9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms