Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms