Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms