Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CCDC180Q9P1Z9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC36.45■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CCDC180Q9P1Z9 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms