Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHRF1Q9P1Y6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms