Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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