Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDE1Q9NZC3 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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