Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PODXL2Q9NZ53 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms