Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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