Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMC4Q9NTJ3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms