Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
ABCC13Q9NSE7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ABCC13Q9NSE7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ABCC13Q9NSE7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABCC13Q9NSE7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABCC13Q9NSE7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABCC13Q9NSE7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABCC13Q9NSE7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABCC13Q9NSE7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABCC13Q9NSE7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABCC13Q9NSE7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABCC13Q9NSE7 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABCC13Q9NSE7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ABCC13Q9NSE7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms