Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

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Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LTBP3Q9NS15 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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