Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms