Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FZD3Q9NPG1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms