Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BPIFA1Q9NP55 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPIFA1Q9NP55 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms