Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms