Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BHLHE41Q9C0J9 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms