Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms