Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NLRP1Q9C000 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms