Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4AQ9BY43 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms