Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KATNB1Q9BVA0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KATNB1Q9BVA0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms