Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf16Q9BUW7 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms