Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR3CQ9BUI4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms