Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms