Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NICN1Q9BSH3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms