Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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