Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms