Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEIS3Q99687 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms