Protein–RNA interactions for Protein: Q96S37

SLC22A12, Solute carrier family 22 member 12, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A12Q96S37 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC22A12Q96S37 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms