Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CICQ96RK0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms