Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms