Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYNGAP1Q96PV0 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms