Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms