Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms