Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SGCZQ96LD1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCZQ96LD1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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